Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms