Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms