Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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