Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH2D2AQ9NP31 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms