Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms