Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms