Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms