Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YTHDF1Q9BYJ9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms