Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms