Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CADM1Q9BY67 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms