Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms