Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms