Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms