Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC32Q9BV29 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms