Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms