Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms