Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms