Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms