Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40CQ96S21 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40CQ96S21 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB40CQ96S21 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40CQ96S21 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40CQ96S21 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB40CQ96S21 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB40CQ96S21 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RAB40CQ96S21 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RAB40CQ96S21 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RAB40CQ96S21 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB40CQ96S21 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB40CQ96S21 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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