Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms