Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YTHDC1Q96MU7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms