Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms