Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SAMD8Q96LT4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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