Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SENP8Q96LD8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms