Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX22Q96L94 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms