Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM7

L3MBTL3, Lethal(3)malignant brain tumor-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3MBTL3Q96JM7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
L3MBTL3Q96JM7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L3MBTL3Q96JM7 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms