Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms