Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC35A4Q96G79 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC35A4Q96G79 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms