Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms