Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms