Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4CQ96CF2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms