Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms