Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYTL4Q96C24 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms