Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRG4Q92954 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms