Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRAT1Q92837 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms