Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms