Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms