Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms