Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms