Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms