Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms