Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms