Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms