Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms