Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEM1Q6ZVN7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms