Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms