Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms