Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms