Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18B1Q6NT16 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18B1Q6NT16 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18B1Q6NT16 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms