Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms